Библиотеката на факултета е структурирана едновременно с неговото основаване. През целия период постъпват много книги и библиотечни единици чрез дарения и чрез разработени и успешно защитени проекти. Тук трябва да бъдат споменати имената на първата библиотекарка Камелия Константинова, на Зоран Мамучевски и на Петя Иванова, които не жалят усилия Библиотеката на ПБФ да отговаря на всички изисквания и да бъде винаги в услуга на студентите и преподавателите от ПБФ и ВТУ.
Учредяването на ПБИЦ (Православен библиотечно-информационен център) “Проф. Тотю Коев”, подпомага библиотеката и обслужва информационно преподавателите и студентите от ПБФ и ВТУ. За целта ПБИЦ е оборудван със съвременна техника, обособен е мултимедиен център, което дава възможност за реализирането на извънредни и допълнителни лекции, представяния, обсъждания и провеждането на семинари на различни теми. В него успешно се организира и допълнително езиково обучение. Специализираната библиотека на ПБИЦ, реализирана съвместно с Фондация „Покров Богородичен” - София, натрупва над 7 000 тома книги и над 6 000 издания периодичен печат. Библиотеката непрекъснато се обновява с нови издания.
На 25.7.2007 г. гл. ас. д-р Свилен Тутеков е определен от Деканския съвет за отговорник на библиотеката на факултета.
Книжният фонд на библиотеката постоянно се попълва както чрез закупуване на книги от ВТУ, така и от нови дарения от Германия и Чехия, а също и от частни лица. Особено важно е сътрудничеството с „Колегия библика”, гр. София, която предоставя повтарящи се копия от постъпленията в своя фонд. В това отношение ПБФ дължи благодарност на отец проф. Николай Шиваров, който дарява 200 тома от своята лична библиотека. Също така в библиотеката постъпва дарение и от проф. Тодор Събев, както и част от личната библиотека на първия декан на факултета – проф. Тотю Коев. В Центъра се оформя и отделен фонд с много ценна литература, закупена по проекти.
Без съмнение библиотеката е от изключително значение за работата на Факултета. През 2009 г. е решен основен проблем с отпускането на щат за библиотекар. Това дава възможност за пълноценна работа на преподавателите и студентите. До откриването на щата това работно място е заемано на половин щат и се дели с координатора на Православния центъра „Тотю Коев”. Библиотеката работи всеки делничен ден с приемно време от 8:00 ч. до 16:30 ч. Постоянно постъпва нова литература, закупена от Централна университетска библиотека или под формата на дарения от различни лица и организации. Броят на постъпилите от дарения книги и периодични издания през последните години е общо 922, от които 748 бр. от дарения и 174 бр. от покупки. Поръчани са с докладни записки 97 книги и 7 стенни карти. Библиотечния фонд се обработва постоянно. През отчетния период инвентаризираните в библиотечната програма книги са 1015 бр.
За периода 2012-2017 година в библиотеката са постъпили общо 1944 бр. книги и 218 бр. периодични издания. Към момента фондът ? е 11 742 тома (книги и периодика общо). През същия период са обслужени 5092-ма читатели (студенти и преподаватели).